Centrum Edukacyjne powstało jako odpowiedź Kościoła Katolickiego, poprzez zakon Ojców Karmelitów, na potrzeby mieszkańców regionu Chiquilistagua, którzy nie mieli możliwości kształcenia swoich dzieci. Zaczęło się od nazwy: "Szkoła Podstawowa Niño Jesús de Praga", której zatwierdzenie znajduje się w uchwale Ministerstwa Edukacji z dnia 16 lutego 1970 roku.
W 1990 r. zgromadzenie zakonne karmelitów przejęło pracę społeczną i 1 marca 1990 r. zmieniło nazwę na: Centro Educativo Niño Jesús de Praga z trybem przedszkolnym, podstawowym i średnim. W dniu 14 stycznia 2005 r., w odpowiedzi na rzeczywistość i zapotrzebowanie uczniów, została otwarta jako przedszkole, szkoła podstawowa, regularna szkoła średnia i technikum.